Αίσθηση προκάλεσε η αποκάλυψη του Χουάν Κάρλος Κρουζ, ενός εκ των επιζήσαντων του σκανδάλου σεξουαλικής κακοποίησης από καθολικούς ιερείς στη Χιλή, ότι ο Πάπας Φραγκίσκος του είπε πως ο Θεός τον έκανε gay και τον αγαπά.
Ο Κρουζ υποστήριξε ότι στην ιδιωτική συνάντηση που είχε πριν από δύο εβδομάδες με τον Ποντίφικα για την κακοποίηση που υπέστη στα χέρια μερικών εκ των πιο άγριων παιδόφιλων στη Χιλή, οι δύο τους συζήτησαν το θέμα της σεξουαλικότητάς του επειδή ορισμένοι από τις επισκόπους της εκκλησίας της Χιλής τον αποκάλεσαν «ανώμαλο» και τον κατηγόρησαν ότι ψεύδεται για όσα πέρασε στα χέρια ιερέων στο παρελθόν.
«Εκείνος μου είπε ότι δεν έχει σημασία που είμαι gay. Ο Θεός σε έκανε έτσι και σε αγαπά έτσι και εμένα δεν με νοιάζει. Ο Πάπας σε αγαπά έτσι. Πρέπει να είσαι χαρούμενος με ό,τι είσαι» δήλωσε ο Κρουζ στην ισπανική El Pais για όσα φέρεται να του είπε ο Πάπας Φραγκίσκος.
Ο 87χρονος Φερνάντο Καραντίμα, ο ιερέας που κακοποίησε τον Κρουζ, κρίθηκε ένοχος από το Βατικανό το 2011.
Αυτή δεν είναι πάντως η πρώτη φορά που ο Φραγκίσκος κάνει μια τέτοια δήλωση ανοχής για την ομοφυλοφιλία παρά τις περί του αντιθέτου διδαχές της καθολικής εκκλησίας. Τον Ιούλιο του 2013 κλήθηκε να τοποθετηθεί για το αν υπάρχει «gay λομπι» με τον ίδιο να απαντά «ποιος είμαι εγώ που θα το κρίνω αυτό;».
Ο βιογράφος του Πάπα έχει γράψει ότι ο Φραγκίσκος έχει κάνει τέτοιου είδους σχόλια και σε ιδιωτικές συζητήσεις στο παρελθόν, όταν ήταν ο πνευματικός καθοδηγητής ομοφυλόφιλων στο Μπουένος Άιρες.
